Vzhledem ke své poloze je Indický oceán nejteplejším světovým oceánem. Velká část jeho plochy se nachází v tropickém nebo subtropickém podnebném pásu. Pro oblast severně od rovníku je charakteristické monzunové podnebí. Na severovýchodě přicházejí monzuny od prosince do dubna, vanou od pevniny, proto počasí je poměrně suché.  Jihozápadní monzun ovlivňuje oblast od června do října a přináší pravidelné deště. V oblasti se mohou objevovat i tropické cyklony, a to především v květnu a říjnu. Nejteplejšími oblastmi jsou Perský záliv a Rudé moře.